通常情况下，高新技术企业认定审计需要约1-2个月的时间。具体时间还要根据企业所在地税务局及相关管理部门的流程要求等因素综合考虑。如果企业资料齐备、递交材料及时并符合认定政策，审计的时间会相对较短。但如遇到资料不完整或存在争议的情况，审计的时间可能会延长。因此，企业在申请认定前需要仔细准备相关资料，并咨询专业人士以规避审核过程中可能遇到的问题。